上海申康医院发展中心是2005年9月由市政府设立的市政府办医的责任主体和市级医院国有资产投资管理运营的责任主体，具体承担28家市级医院的办医职责和10家三级医院的合作共建任务，推进医院的建设发展和深化改革。
自成立以来，申康中心分阶段推进市级医院医学科研和科技创新工作。一是自成立以来，立足办医主体职能定位，推动市级医院学科人才队伍建设，开展了五大类606项临床科技创新项目，提升资源配置能力，为临床诊疗能力提升和医学科技创新活动打下扎实的基础。二是2016年启动了《促进市级医院临床技能和临床科技创新三年行动计划》，首轮立项资助239个项目，包括重大疾病临床技能提升、疑难疾病精准诊治攻关、专科疾病临床“五新”转化和常见疾病适宜技术研发与推广应用等四大类，旨在鼓励市级医院有效整合临床医学研究力量和资源优势，开展高质量临床研究，取得一批在国际上有重要影响的临床医学研究成果，培养一批国内外知名的临床医学专家，用若干年时间使上海市级医院的临床医学研究走在全国前列，进入国际先进水平。三是2018年以来，在前述工作基础上，积极探索临床管理体系优化，筹建申康临床研究院，并在临床研究成果转化等方面开拓探索，推动市级医院跨越发展，让人民群众共享医学科技进步成果。
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